134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2682 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  100 
 
 
116 aa  224  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  76.72 
 
 
116 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  75.86 
 
 
116 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  81.9 
 
 
116 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  81.74 
 
 
116 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  81.03 
 
 
115 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  46 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  42.86 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  48.68 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  38.32 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  35.51 
 
 
192 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  46.05 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  36.99 
 
 
276 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  45.07 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  41.84 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  41.84 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  44.74 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  40.82 
 
 
191 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  43.42 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  40.82 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  40.82 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  38.82 
 
 
171 aa  53.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  38.82 
 
 
171 aa  53.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  39.62 
 
 
204 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  39.62 
 
 
204 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  39.62 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  42.17 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  43.06 
 
 
199 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  36.84 
 
 
201 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  44.29 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  43.08 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  38.66 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  49.18 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  50 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  35.9 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  34.55 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  35.9 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  35.9 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  35.9 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  35.9 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  46.05 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  45 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  33.96 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  38.36 
 
 
279 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  32.32 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  48.33 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  42.17 
 
 
282 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  42.19 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  36.99 
 
 
279 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  33.94 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  39.73 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  32.69 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  42.19 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  34.78 
 
 
278 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  35.58 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  38.64 
 
 
191 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1649  transport-associated protein  32.26 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  37.14 
 
 
191 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  38.64 
 
 
191 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  34.78 
 
 
275 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  38.64 
 
 
191 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  38.64 
 
 
191 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  38.64 
 
 
191 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  38.24 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  43.55 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  40.21 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  36.54 
 
 
219 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  44.26 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  37.08 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  37.5 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1174  transport-associated  40 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382619  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  43.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  41.03 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  40.98 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  42.62 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  41.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  42.62 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>