110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1446 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  100 
 
 		 125 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  37.19 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  37.19 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  46.67 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  35.54 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  38.32 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  35.54 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  43.04 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  38.53 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  40.24 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  36.17 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  40.28 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  40.26 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  33.33 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  45.33 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  41.33 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  41.9 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  36.25 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  38.95 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  41.33 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  40 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  45.31 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  45.31 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  39.24 
 
 		 275 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  46.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  46.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  46.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  32.61 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  36.84 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  44.44 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  36.84 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  35.37 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  32.29 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  45.07 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  43.28 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  43.55 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  43.75 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  33.7 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  41.79 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  34.25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  43.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  43.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  43.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  43.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  43.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  35.63 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  38.71 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  47.54 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  32.76 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  39.24 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  39.24 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  35.8 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  36.11 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  37.8 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  35.96 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  45 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  40.32 
 
 		 278 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  34.21 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  36.59 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  45 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  45 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  45 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  40 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  40.62 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  30.95 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  31.08 
 
 		 192 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  30.95 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  30.67 
 
 		 192 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  30.67 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  42.86 
 
 		 221 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  37.78 
 
 		 150 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  37.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  37.78 
 
 		 150 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  32.79 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>