156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5083 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  47.95 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  42.16 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  38.1 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  45.21 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  46.58 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  43.24 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  44.12 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  42.31 
 
 		 204 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  43.59 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  42.31 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  42.31 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  40.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  40.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  42.65 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  40.48 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  42.65 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  40.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  40.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  40.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  40.48 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  43.59 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.38 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  40 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6723  hypothetical protein  61.9 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  36.25 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  40.24 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  43.08 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  42.05 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  41.18 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  36.36 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  38.24 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  38.24 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  37.84 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  42.31 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  40.91 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  40.3 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  31.43 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  43.37 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  43.37 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  36.49 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  36.49 
 
 		 279 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  31.68 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  38.57 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  37.84 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  39.71 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  39.71 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  32.35 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  38.24 
 
 		 196 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  36.11 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  37.35 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  40 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  36.36 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  40 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  39.74 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  41.18 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  41.18 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  46.67 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  45.71 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  31.11 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  38.89 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  38.89 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  34.72 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  37.14 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  37.14 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  30.93 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  45 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  31.96 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  38.24 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  34.78 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  41.67 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  31.52 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  30.43 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  37.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  33.72 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  32.91 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  32.89 
 
 		 273 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  27.47 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  27.47 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  33.82 
 
 		 275 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  37.5 
 
 		 275 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  30.95 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  36.23 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  27.47 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  34.29 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  37.33 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  31.4 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  33.33 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>