65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4984 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  100 
 
 		 113 aa  220  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  60.68 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  47.46 
 
 		 118 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  44.35 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  46.09 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  43.36 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  45.76 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  48.42 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  42.86 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  41.38 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  56.34 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  41.23 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  55.88 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  55.88 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  54.79 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  55.88 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  54.79 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  54.79 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  54.79 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  54.79 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  54.79 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  54.79 
 
 		 221 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  62.26 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  62.26 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  53.52 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  59.09 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  43.43 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  42.34 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  42.5 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  51.47 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  36.11 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  35.51 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  37.04 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  33.01 
 
 		 412 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  60 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  34.26 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  49.09 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  49.09 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3423  transport-associated  44.62 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  36.25 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  51.11 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  36.25 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  51.11 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  50 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  53.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  34.26 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  51.11 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  31.4 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  33.71 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  36.67 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  31.2 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  32.11 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  38.1 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  38.1 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  38.1 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  32.29 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  45.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  52.78 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  37.68 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  40 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  29.81 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  34.88 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  35.29 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  44.68 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  38.18 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>