105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4015 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  100 
 
 		 118 aa  240  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  70.41 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  55.65 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  53.91 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  53.68 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  48.72 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  47.86 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  44.35 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  57.14 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  54.67 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  52.63 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  56.52 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  45.54 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  45.54 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  43.27 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  43.27 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  43.27 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  54.17 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  54.17 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  54.17 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  45.19 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  52 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  52.86 
 
 		 221 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  52 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  52 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  45.1 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  41.23 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  41.88 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  38.14 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  44.68 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  44.68 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  44.68 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  38.74 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  38.32 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  44.78 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  41.25 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  43.28 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  37.14 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  30.28 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  41.89 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  41.89 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  41.89 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  42.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  32.18 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  33.07 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  37.96 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  36.05 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  32.28 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  40.28 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  34.29 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  34.29 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  39.68 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  39.68 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  43.86 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  42.86 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  30 
 
 		 412 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  35.56 
 
 		 308 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  40.91 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  40.91 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  34.29 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  30 
 
 		 307 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  41.27 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  39.13 
 
 		 543 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  38.46 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3925  putative phophoslipid binding protein  33.33 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  33 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  51.06 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  40.35 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  36.92 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  40.35 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  39.06 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  39.06 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  39.06 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  39.06 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  39.06 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 447 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  42 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  42 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  38.98 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  42 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  36.62 
 
 		 244 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  38.98 
 
 		 158 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  36.23 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  37.88 
 
 		 217 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  33.71 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  38.98 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  33.33 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  37.5 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  28.74 
 
 		 309 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  43.1 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>