110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0799 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  100 
 
 
117 aa  223  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  94.02 
 
 
117 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  72.88 
 
 
118 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  58.97 
 
 
119 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  56.14 
 
 
119 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  55.26 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  53.45 
 
 
118 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  55.28 
 
 
120 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  59.65 
 
 
118 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  50 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  56.45 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  56.45 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  54.84 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  54.84 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  54.84 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  65.33 
 
 
222 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  54.03 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  61.33 
 
 
221 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  61.33 
 
 
221 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  61.33 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  61.33 
 
 
221 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  61.33 
 
 
294 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  61.33 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  61.33 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  49.52 
 
 
116 aa  85.9  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  47.37 
 
 
115 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  47.41 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  42.98 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  39.09 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  45.16 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  48 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  45.45 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  45.45 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  46.15 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  46.75 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  38.05 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  39.81 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  44.19 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  44.19 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  44.19 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  33.94 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  37.23 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  33.62 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  30.77 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  37 
 
 
543 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  34.48 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  43.94 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  35.71 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  43.94 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  43.94 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  43.94 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  43.94 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  36.05 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  42.42 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  36.92 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  42.42 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  42.42 
 
 
201 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  37.35 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  47.46 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  39.08 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  41.27 
 
 
204 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  30.95 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  41.27 
 
 
204 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  31.58 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  41.67 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  40 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  40 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  32.98 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  40 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  32.98 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  40 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  45 
 
 
204 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  40 
 
 
246 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  41.67 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  41.18 
 
 
412 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  32.88 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  43.33 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  43.33 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  30.69 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  30.69 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  32.38 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  41.54 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  32.38 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  41.54 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  41.54 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  33.33 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 
447 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3423  transport-associated  30.56 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  36.23 
 
 
240 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  33.85 
 
 
223 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  42.62 
 
 
142 aa  40.8  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>