28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5747 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  97.67 
 
 		 129 aa  246  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  46.58 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  46.58 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  46.58 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  41.77 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  35.09 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  34.43 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  40.19 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  39.25 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  44.87 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  35.71 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  35.71 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  35.71 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  42.31 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  35.14 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  37.23 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  32.97 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  33.07 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  36.56 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  36.56 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  39.19 
 
 		 235 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  32.97 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  31.2 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  32.73 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  34.83 
 
 		 275 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  36.62 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>