60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3931 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  100 
 
 
121 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  83.47 
 
 
120 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  88.43 
 
 
121 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  88.43 
 
 
121 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  88.43 
 
 
121 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  86.78 
 
 
121 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  86.78 
 
 
121 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  70.67 
 
 
294 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  70.67 
 
 
221 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  70.67 
 
 
221 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  59.84 
 
 
122 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  59.84 
 
 
122 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  59.84 
 
 
122 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  69.33 
 
 
221 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  56.56 
 
 
222 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  50.82 
 
 
119 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  50 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  54.55 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  47.06 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  53.23 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  54.03 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  48.08 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  57.53 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  49.48 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  40.68 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  47.52 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  43.48 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  40.52 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  40 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  37.5 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  37.33 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  38.52 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  35.65 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  32.2 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  32.2 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  32.2 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  32.23 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  37.5 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  35.48 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  35.48 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  34.71 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  31.4 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  27.2 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  32.39 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  43.48 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  48.84 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  48.84 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  34.86 
 
 
139 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  41.3 
 
 
199 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  48.84 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  48.84 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  48.84 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  37.1 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  32.39 
 
 
240 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.14 
 
 
543 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  29.92 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  29.07 
 
 
309 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  28.57 
 
 
204 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  28.57 
 
 
204 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  28.57 
 
 
204 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>