63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1716 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  100 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  44.55 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  50 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  50 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  43.01 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  38.98 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  38.39 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  36.8 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  36.89 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  43.33 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  46.05 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  38.32 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  38.74 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  46.38 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  34.43 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  39.76 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  36.17 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  35.14 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  35.58 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  35.4 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  35.4 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  35.4 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  44.74 
 
 
222 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  43.84 
 
 
221 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  31.68 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  37.04 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  43.84 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  43.84 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  43.06 
 
 
221 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  43.84 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  43.06 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  43.84 
 
 
294 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  40.24 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  36.99 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  36.99 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  36.99 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  39.47 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  31.67 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  37.5 
 
 
235 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  37.66 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  32 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  33.96 
 
 
192 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  38.36 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  39.13 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  39.13 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  39.13 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  39.13 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  38.24 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  36.36 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  30 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  38.24 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  38.24 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  30.68 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  41.43 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  41.43 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  36.59 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  39.77 
 
 
278 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  38.71 
 
 
246 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  30.93 
 
 
175 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  34.83 
 
 
174 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  36.23 
 
 
142 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  42 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>