89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6356 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  100 
 
 		 125 aa  244  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  38.21 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  48.94 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  41.18 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  40.68 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  42.11 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  42.34 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  43.04 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  38.74 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  47.89 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  41.23 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  40 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  40.32 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  36.21 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  44.59 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  36.67 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  36.36 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  36.04 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  40.71 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.89 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.89 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.89 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  34.88 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  31.03 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  43.06 
 
 		 294 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  36.56 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  35.45 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  36.56 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  43.06 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  43.06 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  46.03 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  43.06 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  43.06 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  43.06 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  30.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 221 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  34.19 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  34.19 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  34.19 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  35.63 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  40 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  32.79 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  45.9 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  37.66 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  45.9 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  32.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  32.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  32.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  32.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  44.12 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  32.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  44.12 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  32.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  44.12 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  32.81 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  32.81 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  32.81 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  32.81 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  40.28 
 
 		 201 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  32.81 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.46 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  42.42 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  41.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  41.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  34.52 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  34.86 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  32.05 
 
 		 244 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  39.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  30.26 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  32.46 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  39.39 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3235  transport-associated  34.25 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.026553  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  42 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  34.33 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  38.89 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  35.94 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  33.73 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  38.33 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  32.1 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  38.33 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  42 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  42 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  39.73 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1030  transport-associated protein  31 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  28.05 
 
 		 326 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>