109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1624 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  100 
 
 
119 aa  234  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  86.55 
 
 
119 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  55.65 
 
 
118 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  53.39 
 
 
118 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  53.45 
 
 
115 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  50.41 
 
 
120 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  55.56 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  48.36 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  48.36 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  48.36 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  47.79 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  50.89 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  45.9 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  45.9 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  60 
 
 
221 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  60 
 
 
222 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
122 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
122 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  58.67 
 
 
122 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  52.14 
 
 
117 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
221 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
221 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  58.67 
 
 
294 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  45.08 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  45.1 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  48.67 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  43.93 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  40.71 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  41.38 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  43.01 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  47.37 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  43.48 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  43.48 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  39.47 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  47.22 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  34.45 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  46.67 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  46.67 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  46.67 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  37.38 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  36.21 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  36.08 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  44.44 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  33.33 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  41.54 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  36.11 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.57 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.57 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.57 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  46 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  46 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  34.69 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  34.69 
 
 
136 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  41.33 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  34.69 
 
 
136 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  41.33 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
246 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
184 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  41.33 
 
 
131 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  34.83 
 
 
174 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  34.78 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  40 
 
 
412 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  34.78 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  53.33 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  35.62 
 
 
244 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  42.42 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  42.42 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  36.36 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  32.73 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  28.89 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  42.19 
 
 
204 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  36.76 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  52.27 
 
 
202 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  32.97 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  37.88 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0139  transport-associated  36.11 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  44 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  52.27 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  44 
 
 
308 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  30.91 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  30.77 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  48.89 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  52.38 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  33.33 
 
 
216 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  31.88 
 
 
216 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  33.33 
 
 
216 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  32.95 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  36.36 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  32.95 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  37.88 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  30 
 
 
307 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  51.16 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  51.16 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  45.1 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  29.2 
 
 
199 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  51.16 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  51.16 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  51.16 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  31.82 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.609853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>