43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3270 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  100 
 
 		 139 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  54.05 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  50 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  50.63 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  38.52 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  41.28 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  50.67 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  50.67 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  35.59 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  37.38 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  45.78 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  45.78 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  45.78 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  38.32 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  41.35 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  45.21 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  43.27 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  35 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  35.45 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  33.02 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  37.23 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  38.1 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  40.24 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  32.97 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  35.16 
 
 		 309 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  36.05 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  31.87 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  37.14 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  37.14 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  37.14 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  28.83 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  39.13 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  34.25 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  30.67 
 
 		 221 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  30.67 
 
 		 221 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  35.62 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  31.51 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  31.51 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  31.51 
 
 		 294 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  31.51 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  33.85 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  37.88 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>