95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3885 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  100 
 
 		 135 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  79.26 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  61.33 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  41.18 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  39.55 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  42.98 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  42.98 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  54.93 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  42.24 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  53.52 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  39.34 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  38.1 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  42.27 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  36.51 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  37.35 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  47.83 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  39.29 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  40.48 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  38.14 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  38.14 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  38.14 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  50.72 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  46.97 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  44.44 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  44.44 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  35.77 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  40.28 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  36.99 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  34.94 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  33.88 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  38.3 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  38.89 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  40 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  36.23 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  36.23 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  36.23 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  36.23 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  49.12 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  38 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.03 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  40.58 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  36.36 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  35.48 
 
 		 200 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  36.36 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  35.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  39.39 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  35.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  33.33 
 
 		 307 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  35.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  37.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  37.68 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  37.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  42.42 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  47.27 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  47.27 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  47.27 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  32.88 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  36.23 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  36.36 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  37.88 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  39.39 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  38.36 
 
 		 235 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  37.88 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  38.81 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  31.52 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  34.62 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  33.78 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  37.68 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  30.53 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  33.94 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  39.39 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  40 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  36.23 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  34.67 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  37.68 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  34.67 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  37.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  33.75 
 
 		 278 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>