138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5562 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  81.02 
 
 		 216 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  68.37 
 
 		 216 aa  279  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  64.65 
 
 		 216 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  64.19 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  66.2 
 
 		 216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  61.57 
 
 		 226 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  54.63 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  56.34 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  55.56 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  63.26 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  63.26 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  63.26 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  63.26 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  63.26 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  53.66 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  53.49 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  53.49 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  53.95 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  53.95 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  64.1 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  64.1 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  50 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  47.44 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  46.51 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  47.22 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  46.51 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  46.76 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  45.37 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  45.37 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  52.09 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  51.16 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  51.16 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  48.61 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  51.16 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  51.16 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  44.81 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  46.63 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  50.7 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  50.7 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  45.58 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  40.47 
 
 		 216 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  46.3 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  46.01 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  43.4 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  44.13 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  40.93 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  42.06 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  39.62 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.53 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  42.06 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  44.19 
 
 		 217 aa  147  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  41.23 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  38.5 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  39.53 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.79 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  39.35 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  40.74 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  39.44 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  38.97 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  37.96 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  39.15 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  38.43 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  36.45 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  46.43 
 
 		 141 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  39.34 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  39.81 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  40.19 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  38.99 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  31.16 
 
 		 203 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  34.76 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.69 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  27.56 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  29.2 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  46.27 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  25.74 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.85 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  32.21 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  39.71 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  29.85 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  28.78 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.2 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.19 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.19 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.19 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  24.03 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  30.41 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  30.41 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  32.24 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  42.86 
 
 		 315 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  24.19 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  34.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  24.69 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  34.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  34.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  34.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  34.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.03 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  26.75 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>