44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1310 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  45.71 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  48.82 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  34.06 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  29.41 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  29.85 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  28.15 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  29.71 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  29.71 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  31.62 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  31.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  29.86 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  29.75 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  30.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  29.63 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  30.6 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  31.4 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  26.76 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  29.85 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  27.61 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  27.61 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  27.61 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  27.61 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  27.61 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  24.52 
 
 		 278 aa  47.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  27.61 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  27.69 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  28.36 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  30.07 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  27.97 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  25.81 
 
 		 275 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  26.45 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  28.06 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  26.43 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  32.86 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  25.95 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  24.82 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  30.95 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  26.19 
 
 		 192 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  26.67 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  29.36 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  25.18 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  22.63 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  26.87 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>