98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1101 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  100 
 
 
216 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  72.68 
 
 
216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  70.37 
 
 
216 aa  300  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  51.16 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  51.63 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  54.63 
 
 
216 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  50.23 
 
 
216 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  50.93 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  49.07 
 
 
226 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  49.07 
 
 
216 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  44.13 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  50.7 
 
 
216 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  50.7 
 
 
216 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  50.7 
 
 
216 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  50.7 
 
 
216 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  50.7 
 
 
216 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  42.33 
 
 
216 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  44.6 
 
 
215 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  38.14 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  44.65 
 
 
215 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  44.65 
 
 
215 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.98 
 
 
217 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  42.59 
 
 
217 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  39.35 
 
 
219 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  51.28 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  51.28 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  38.89 
 
 
217 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  40.57 
 
 
216 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  38.43 
 
 
217 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  38.43 
 
 
217 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  40.19 
 
 
217 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  39.07 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  40.38 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  38.6 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  40.38 
 
 
214 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  37.5 
 
 
215 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  37.5 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  38.21 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  36.32 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  39.35 
 
 
215 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  37.74 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  38.5 
 
 
215 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  34.42 
 
 
217 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  37.56 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  38.43 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  38.43 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  38.43 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  38.43 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  36.92 
 
 
215 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  37.96 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  37.96 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  33.64 
 
 
223 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  37.56 
 
 
215 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  38.5 
 
 
214 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  36.45 
 
 
215 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  38.68 
 
 
216 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  38.68 
 
 
216 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  36.57 
 
 
216 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  36.45 
 
 
215 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  35.35 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  37.33 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  37.89 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  37.79 
 
 
216 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  32.72 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  33.95 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  41.83 
 
 
178 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  32.73 
 
 
228 aa  104  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  35.21 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  37.96 
 
 
141 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  30.81 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  30.56 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  26.7 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  23.53 
 
 
278 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  45.57 
 
 
108 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  22.52 
 
 
275 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  48.48 
 
 
108 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.32 
 
 
543 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  29.09 
 
 
307 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  41.79 
 
 
76 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  38.33 
 
 
106 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  39.13 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  26.36 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3347  transport-associated  28.83 
 
 
168 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0766802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  44.44 
 
 
309 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  37.68 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  37.68 
 
 
303 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  38.03 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  40.98 
 
 
110 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  30.4 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  35.71 
 
 
115 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  29.46 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  25.55 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  29.46 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  27.08 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  25.45 
 
 
279 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  31.88 
 
 
119 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>