24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3347 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3347  transport-associated  100 
 
 		 168 aa  331  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0766802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3482  transport-associated  37.71 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4528  transport-associated protein  37.01 
 
 		 159 aa  84.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0531104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  55 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  31.71 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  29.73 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  32.31 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  31.82 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  27.82 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  37.31 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  34.17 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 439 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4065  putative phophoslipid binding protein  29 
 
 		 319 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.279437  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  26.09 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  34.86 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  26.13 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  34.35 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  27.48 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  42.86 
 
 		 217 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  33.08 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  39.13 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  37.1 
 
 		 106 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  42.62 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  39.13 
 
 		 231 aa  40.8  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>