127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2456 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  54.88 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  52.34 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  47.66 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  47.91 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  45.28 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  47.47 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  47.2 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  49.54 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  50.7 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  46.05 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  52.58 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  53.05 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  44.17 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  43.93 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  42.45 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  42.33 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  40.93 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  43.98 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  43.98 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  40.38 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  45.02 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  42.13 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  43.66 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  43.66 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  42.72 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  40.65 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  41.23 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  41.59 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  40.93 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  40.65 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  38.97 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  39.07 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  41.23 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  45.16 
 
 		 178 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  39.44 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  38.97 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  36.62 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  35.68 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  34.27 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  34.27 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  40.65 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  36.15 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  35.98 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  37.56 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  38.5 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  40.28 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  32.86 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  36.07 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  35.64 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  36.92 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  36.92 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  36.92 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  36.92 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  36.92 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  36.92 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  37.38 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  35.98 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  36.45 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  37.56 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  37.56 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  37.56 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  37.56 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  37.56 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  38.97 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  38.16 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  38.46 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  30.05 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  40.83 
 
 		 141 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  30.37 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  46.25 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  47.5 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  28.85 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  25.63 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  23.4 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.04 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  38.36 
 
 		 106 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  24.88 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.05 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  23.29 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  24.68 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  27.01 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  23.86 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  27.68 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  24.44 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  29.63 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  25.94 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  27.93 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  25.95 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  28.12 
 
 		 628 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  28.22 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  30 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.15 
 
 		 307 aa  45.1  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  29.92 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  29.92 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  30.56 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  29.92 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>