44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3482 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3482  transport-associated  100 
 
 		 165 aa  320  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3347  transport-associated  38.07 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0766802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4528  transport-associated protein  43.51 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0531104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  30.43 
 
 		 275 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  34.48 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  31.91 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  32 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  30.15 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  34.62 
 
 		 214 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  30.99 
 
 		 273 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  35.09 
 
 		 543 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  35.23 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  33.63 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  31.91 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  31.91 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  34.51 
 
 		 214 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  30.51 
 
 		 217 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  31.91 
 
 		 103 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  40 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  28.99 
 
 		 228 aa  44.3  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  30.53 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 459 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  27.12 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  31.25 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  31.25 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  33.33 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1133  transport-associated  44.68 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  27.41 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  32.81 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  37.68 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  48.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  31.21 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  30.51 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  26.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  30.5 
 
 		 273 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  26.52 
 
 		 215 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  26.77 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  27.12 
 
 		 215 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  29.82 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  38.78 
 
 		 244 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  30.16 
 
 		 216 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  29.41 
 
 		 243 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  29.89 
 
 		 217 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>