155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2264 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  100 
 
 
216 aa  427  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  55.81 
 
 
215 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  56.74 
 
 
215 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  57.21 
 
 
215 aa  234  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  53.7 
 
 
215 aa  231  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  56.48 
 
 
215 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  54.88 
 
 
215 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  50.46 
 
 
216 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  52.09 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  47.93 
 
 
216 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  48.17 
 
 
216 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  47.22 
 
 
216 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  53.05 
 
 
216 aa  201  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  48.15 
 
 
214 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  54.46 
 
 
216 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  45.79 
 
 
217 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  54.46 
 
 
216 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  48.15 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  46.3 
 
 
214 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  45.58 
 
 
217 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  45.79 
 
 
215 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  44.39 
 
 
214 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  46.26 
 
 
215 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  46.26 
 
 
215 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  41.31 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  56.13 
 
 
178 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  41.59 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  43.93 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  41.86 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  44.65 
 
 
223 aa  171  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  42.79 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  42.52 
 
 
217 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  43.72 
 
 
216 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  42.52 
 
 
217 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  42.52 
 
 
216 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  43.52 
 
 
220 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  41.12 
 
 
216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  43.26 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  44.65 
 
 
226 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  42.99 
 
 
216 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  41.4 
 
 
216 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  38.14 
 
 
217 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  38.14 
 
 
217 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  40.47 
 
 
216 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  40.47 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  37.96 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  36.74 
 
 
217 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  44.44 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  39.9 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  38.6 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  40.93 
 
 
237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  40.74 
 
 
215 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  39.72 
 
 
215 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  40.47 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  40.28 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  40.28 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  40.28 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  40.65 
 
 
216 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  40.65 
 
 
216 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  40.65 
 
 
216 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  40.65 
 
 
216 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  40.65 
 
 
216 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  37.5 
 
 
233 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  36.74 
 
 
213 aa  121  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  37.21 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  37.21 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  40.82 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  40.82 
 
 
197 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  30.41 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  37.4 
 
 
141 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  29.67 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.32 
 
 
543 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  43.59 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  42.31 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  28.03 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  27.7 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  39.13 
 
 
106 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  45.07 
 
 
309 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  28.79 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  26.35 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  26.35 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  26.35 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  26.34 
 
 
282 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  26.09 
 
 
245 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  23.83 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26.12 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  38.16 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  23.11 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  41.18 
 
 
303 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  29.29 
 
 
307 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  28.47 
 
 
201 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  27.74 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  39.71 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  27.74 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  34.72 
 
 
86 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  28.97 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  27.74 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  27.74 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  32.54 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  27.74 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>