45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1047 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3925  putative phophoslipid binding protein  46.79 
 
 
193 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  45.74 
 
 
249 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  31.79 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  32.89 
 
 
220 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  29.14 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  29.56 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  30.67 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  30.92 
 
 
217 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  28.97 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  28.05 
 
 
543 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  31.13 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  29.41 
 
 
217 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  29.58 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  30.41 
 
 
215 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  30.41 
 
 
215 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  35.17 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  30 
 
 
214 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  33.61 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  30.13 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  30.08 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  29.33 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  43.42 
 
 
309 aa  45.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  31.85 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  31.13 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  31.85 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  31.85 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  31.85 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  31.85 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  29.82 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  30.08 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  30.89 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  28.47 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.61 
 
 
307 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  29.6 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.72 
 
 
275 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  28.57 
 
 
273 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  30.46 
 
 
197 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  25.28 
 
 
273 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  30 
 
 
218 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  27.81 
 
 
216 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  29.69 
 
 
255 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  24.61 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  29.69 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  26.09 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>