139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6897 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  56.74 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  52.78 
 
 		 220 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  53.49 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  56.02 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  45.33 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  42.52 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  40.74 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  41.51 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  40.28 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  41.1 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  41.04 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  41.59 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  39.35 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  40 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  40 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  36.57 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  40.78 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  38.14 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  43.13 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  41.12 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  38.97 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  40.28 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  43.46 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  41.71 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  36.45 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  39.07 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  39.81 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  39.81 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  39.53 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  36.74 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  41.67 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  38.6 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  36.57 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  42.18 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  39.53 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  42.18 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  38.6 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  38.99 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  34.42 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  36.41 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  40.37 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  37.38 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  32.87 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  33.8 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  39.34 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  32.87 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  36.28 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  35.35 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  35.12 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  34.42 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  34.42 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  34.42 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  34.42 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  34.42 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  34.42 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  33.95 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  39.1 
 
 		 178 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  38.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  38.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  38.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  38.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  38.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  30.27 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  33.02 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  37.67 
 
 		 141 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  31.16 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.02 
 
 		 543 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  36.56 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  37.1 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5904  hypothetical protein  85.42 
 
 		 65 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.749534  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  28.9 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  28.51 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  32.43 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  26.55 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  34.01 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  33.57 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  33.56 
 
 		 628 aa  58.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.7 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.08 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.08 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.08 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.97 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  43.48 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  44.93 
 
 		 108 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  25.12 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  31.03 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  27.51 
 
 		 282 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  30.92 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  25.12 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  26.82 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  26.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3482  transport-associated  32 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0562  transport-associated  35.9 
 
 		 300 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  32.19 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  43.66 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  42.47 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  27.96 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>