120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6056 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  100 
 
 
226 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  39.67 
 
 
214 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  37.93 
 
 
215 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  33.33 
 
 
217 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  37.93 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  36.19 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  37.14 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  36.22 
 
 
215 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  32.86 
 
 
216 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  36.73 
 
 
215 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  36.73 
 
 
215 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  34.01 
 
 
216 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  34.29 
 
 
217 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  33.18 
 
 
216 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  32.86 
 
 
216 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  33.18 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  34.76 
 
 
216 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  33.33 
 
 
217 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  30.05 
 
 
215 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  34.76 
 
 
216 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  31.28 
 
 
217 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  30.99 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  33.33 
 
 
217 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  32.52 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  32.97 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  33.81 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  33.81 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  38.58 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  34.38 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  38.58 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  38.58 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  38.58 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  38.58 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  31.07 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  39.57 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  31.02 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  32.95 
 
 
217 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  30.52 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  33.82 
 
 
220 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  29.81 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  39.57 
 
 
197 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  29.67 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  34.78 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  32.7 
 
 
215 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  29.65 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  30.81 
 
 
216 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  30.58 
 
 
217 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  35.53 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  33.33 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  30.46 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  36.19 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  36.19 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  36.19 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  36.19 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  36.19 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  36.19 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  34.18 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  34.64 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  33.33 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  32.84 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  32.51 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  35.75 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  32.14 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  33 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  28.9 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  32.84 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  30.05 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  36.61 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  32.89 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  24 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  28.97 
 
 
175 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  27.21 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  29.33 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.03 
 
 
543 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  34.15 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  31.61 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  32.26 
 
 
182 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  29.11 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  28.93 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  26.99 
 
 
282 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  34.53 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  24.55 
 
 
278 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  31.82 
 
 
182 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  32.46 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  32.46 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  29.41 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  32.8 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  24.79 
 
 
255 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  30.39 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  30.39 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.94 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.94 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.94 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  30.89 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  41.54 
 
 
86 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  29.41 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.34 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  29.2 
 
 
183 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  32.84 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>