111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1892 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  100 
 
 
216 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  83.9 
 
 
216 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  70.37 
 
 
216 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  55.81 
 
 
216 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  53.49 
 
 
216 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  53.02 
 
 
216 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  56.02 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  55.56 
 
 
216 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  51.39 
 
 
226 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  51.39 
 
 
216 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  50.23 
 
 
214 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  48.83 
 
 
215 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  46.98 
 
 
216 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  52.56 
 
 
216 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  52.56 
 
 
216 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  52.56 
 
 
216 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  52.56 
 
 
216 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  52.56 
 
 
216 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  46.48 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  46.48 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  39.35 
 
 
219 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.98 
 
 
217 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  42.59 
 
 
217 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  41.67 
 
 
217 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  41.67 
 
 
217 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  42.33 
 
 
217 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  41.4 
 
 
216 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  40.74 
 
 
217 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  51.79 
 
 
197 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  40.47 
 
 
217 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  42.13 
 
 
215 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  51.28 
 
 
197 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  40.57 
 
 
215 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  39.15 
 
 
217 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  39.81 
 
 
215 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  43.98 
 
 
215 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  43.98 
 
 
215 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  35.35 
 
 
217 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  43.98 
 
 
215 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  43.98 
 
 
215 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  43.98 
 
 
237 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  41.51 
 
 
216 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  43.52 
 
 
237 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  43.52 
 
 
215 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  41.78 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  41.18 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  38.97 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  39.44 
 
 
214 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  37.74 
 
 
215 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  37.85 
 
 
223 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  40.57 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  40.57 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  38.79 
 
 
215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  37.21 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  38.81 
 
 
216 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  38.03 
 
 
214 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  36.15 
 
 
215 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  36.15 
 
 
214 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  38.36 
 
 
216 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  34.42 
 
 
217 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  36.28 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  37.33 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  37.96 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  33.18 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  39.44 
 
 
213 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  44.53 
 
 
141 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  34.72 
 
 
228 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  39.22 
 
 
178 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  30.52 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  29.19 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.45 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  26.23 
 
 
543 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  23.87 
 
 
278 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  22.97 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  28.12 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  35.82 
 
 
106 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  40.79 
 
 
108 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  39.47 
 
 
108 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  25.36 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  37.14 
 
 
303 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  40 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  37.14 
 
 
303 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  25.34 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  26.85 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.68 
 
 
307 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  24.29 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  26.99 
 
 
184 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.25 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  35.71 
 
 
301 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.25 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.25 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  29.05 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  23.23 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  28.46 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26.85 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  26.17 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  36.23 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  32.88 
 
 
86 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  27.94 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>