84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2676 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  97.69 
 
 		 303 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  67.28 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  72.64 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  70 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  68.52 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  52.2 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  43.24 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  51.49 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  56.41 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  45.71 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  52.5 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  47.83 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  44.44 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  38.36 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  44.44 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  38.36 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  38.84 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  38.36 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  44.76 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 604 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  49.38 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  43.02 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  43.02 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  43.02 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  46.05 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  43.37 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  30.61 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  46.05 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  46.05 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  52.86 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  44.87 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  43 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  45.21 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  45.21 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  45.21 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  45.21 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  38.16 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  40.58 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  47.54 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  43.28 
 
 		 150 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  43.28 
 
 		 150 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  34.57 
 
 		 106 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  33.33 
 
 		 412 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  41.79 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  36.11 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.57 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  35.71 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  41.43 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  40.85 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  37.31 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  42.03 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  38.89 
 
 		 163 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  37.04 
 
 		 179 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2741  transport-associated protein  35.29 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  38.24 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1868  transport-associated  42.37 
 
 		 176 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257519  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  34.25 
 
 		 217 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  27.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  35.14 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  39.39 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2071  transport-associated  42.37 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  43.28 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  39.71 
 
 		 110 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  38.81 
 
 		 165 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2979  transport-associated protein  36.51 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.484552  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  34.25 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  40 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  38.89 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  43.28 
 
 		 215 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  41.79 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  40.3 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  38.98 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  36.99 
 
 		 134 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 104 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  40.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  32.43 
 
 		 217 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  34.18 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2153  putative phophoslipid binding protein  41.67 
 
 		 127 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  40.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  40.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4728  transport-associated  37.93 
 
 		 165 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  hitchhiker  0.00809324 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  34.78 
 
 		 216 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>