86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3315 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  100 
 
 		 301 aa  588  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  72.64 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  72.64 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  68.87 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  60.16 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  57.98 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  54.74 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  46.85 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  54.43 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  54.02 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  46.3 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  52.5 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  45.37 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  41.84 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  52.63 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  52.63 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  50 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  45.54 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  44.9 
 
 		 170 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  50.6 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  50.6 
 
 		 604 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  50.6 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  50.6 
 
 		 584 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  51.22 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  51.22 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  51.22 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  35.81 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  45.05 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  44 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  36.36 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  46.59 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  44.9 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  45.71 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  43.48 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  42.86 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  42.65 
 
 		 110 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4728  transport-associated  36.17 
 
 		 165 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  hitchhiker  0.00809324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  41.43 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  41.43 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  41.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  44.26 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  44.26 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2741  transport-associated protein  36.11 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  40.58 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  44.26 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  44.26 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  44.26 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  36.84 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  40.98 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  27.89 
 
 		 543 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  34 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  35.62 
 
 		 179 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  34.57 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  37.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  35.71 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  34.57 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  34.57 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.89 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  34.21 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  40 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  38.81 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  36 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  39.34 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  38.36 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  38.81 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  38.03 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  32.58 
 
 		 90 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  38.36 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  40.91 
 
 		 150 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  35.38 
 
 		 412 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  40.91 
 
 		 150 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  39.34 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2153  putative phophoslipid binding protein  34.52 
 
 		 127 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  37.29 
 
 		 216 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  37.31 
 
 		 104 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  35.82 
 
 		 115 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  39.44 
 
 		 214 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  39.34 
 
 		 201 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  34.29 
 
 		 141 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>