33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2741 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2741  transport-associated protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1030  transport-associated protein  39.71 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3235  transport-associated  38.97 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.026553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1191  transport-associated  50.63 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  42.86 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2750  transport-associated protein  33.58 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  35.11 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  35.11 
 
 		 301 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  35.29 
 
 		 303 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  35.29 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  30.26 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  39.13 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  37.68 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  36.92 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  28.69 
 
 		 190 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  32.89 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  31.58 
 
 		 258 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>