13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1030 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1030  transport-associated protein  100 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3235  transport-associated  89.12 
 
 		 147 aa  239  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.026553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  47.48 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1191  transport-associated  58.54 
 
 		 207 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2741  transport-associated protein  39.71 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2750  transport-associated protein  42.86 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0068  hypothetical protein  43.37 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.686512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  26.98 
 
 		 543 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  40 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  28.91 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  30.25 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  30.67 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  33.33 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>