45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3206 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  45.19 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  53.51 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  52.1 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  50.88 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  50.88 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  52.34 
 
 		 244 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  46.15 
 
 		 231 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  42.45 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  39.66 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  46.43 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  34.01 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  42.67 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  46.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  33.33 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  34.26 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  38.32 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  40 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  37.78 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  37.78 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  39.47 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  39.47 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  40.21 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  35 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  35.35 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  35.35 
 
 		 448 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 584 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  35.35 
 
 		 544 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  35.35 
 
 		 544 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 604 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  33.64 
 
 		 170 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  37.21 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  36.23 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  40.98 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  33.75 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1868  transport-associated  44.07 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257519  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  37.84 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  37.7 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2071  transport-associated  44.07 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  37.68 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  40.58 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  36.25 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4477  putative phophoslipid binding protein  31.43 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.780877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  37.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  37.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>