34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3339 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  53.02 
 
 
174 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  53.64 
 
 
355 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  45.87 
 
 
308 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  53.16 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  48.15 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  53.95 
 
 
90 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  39.45 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  34.81 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  45.88 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  36.97 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  44.58 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  35.58 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  34.19 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  46.75 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  34.3 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  41.49 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  34.3 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  36.19 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  40.59 
 
 
288 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  35.81 
 
 
301 aa  68.2  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  46.25 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  42.67 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  42.5 
 
 
326 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  42.22 
 
 
372 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  39.47 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  42.86 
 
 
448 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
604 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
584 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  42.86 
 
 
355 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  42.86 
 
 
521 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  42.86 
 
 
544 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  42.86 
 
 
544 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2750  transport-associated protein  30.99 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>