45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1236 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  100 
 
 
170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  62.22 
 
 
308 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  48.18 
 
 
521 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  59.76 
 
 
604 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  48.18 
 
 
544 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  48.18 
 
 
544 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  54.84 
 
 
584 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  48.18 
 
 
355 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  54.84 
 
 
448 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  62.03 
 
 
178 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  57.69 
 
 
294 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  57.89 
 
 
397 aa  94.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  54.12 
 
 
288 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  57.89 
 
 
287 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  57.89 
 
 
287 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  52.94 
 
 
286 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  57.89 
 
 
244 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  52.58 
 
 
372 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  47.06 
 
 
355 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  48.78 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  52.69 
 
 
367 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  47.83 
 
 
303 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  49.38 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  45.88 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  49.38 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  47.67 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  44.32 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  46.75 
 
 
309 aa  71.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  49.38 
 
 
301 aa  70.9  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  50 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  43.24 
 
 
244 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  42.11 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  38.55 
 
 
313 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  36.67 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  36.76 
 
 
223 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  32.43 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  36.76 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  32.31 
 
 
412 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  35.23 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  37.88 
 
 
275 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  33.82 
 
 
119 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  36.92 
 
 
115 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  32.98 
 
 
217 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  33.33 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  39.39 
 
 
278 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>