30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4375 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  100 
 
 		 372 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  56.63 
 
 		 170 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  52.21 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  56.63 
 
 		 174 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  48.28 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  59.21 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  48.39 
 
 		 308 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  50.96 
 
 		 294 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  59.74 
 
 		 287 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  59.74 
 
 		 287 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  50.51 
 
 		 286 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  54.43 
 
 		 178 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  51.72 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  51.9 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  51.69 
 
 		 210 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  51.11 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  48.72 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  50.67 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  45.33 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  45.33 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  45.56 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  44.44 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  41.35 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  40.21 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  46.67 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  41.98 
 
 		 90 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  37.97 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  33.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  34.33 
 
 		 106 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4728  transport-associated  29.22 
 
 		 165 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  hitchhiker  0.00809324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>