51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4733 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4733  transport-associated  100 
 
 		 326 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  57.43 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  45.19 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  58.87 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  48.62 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  57.93 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  56.91 
 
 		 244 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  55.08 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  47.37 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  48.96 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  33.47 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  36.04 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  36.04 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  36.04 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  48.68 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  45.35 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  40.65 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  38.24 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  38.24 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  37.86 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  37.04 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  50 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  42.5 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  39.8 
 
 		 448 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  40.21 
 
 		 521 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  40.21 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  40.21 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 604 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 584 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  41.84 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  43.04 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  41.35 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  33.64 
 
 		 150 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  33.64 
 
 		 150 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  31.43 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  31.43 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  42.47 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  45.71 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  30.28 
 
 		 220 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  34.12 
 
 		 205 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  31.71 
 
 		 90 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  31.48 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1868  transport-associated  44.07 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257519  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2071  transport-associated  44.07 
 
 		 172 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4728  transport-associated  38.89 
 
 		 165 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  hitchhiker  0.00809324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  38.81 
 
 		 104 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  58 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  42.86 
 
 		 215 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  40.28 
 
 		 214 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  42.86 
 
 		 215 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>