14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4728 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4728  transport-associated  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  hitchhiker  0.00809324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2071  transport-associated  49.35 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1868  transport-associated  46.91 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257519  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2024  hypothetical protein  40.13 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  34.17 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  36.11 
 
 		 315 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  39.66 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  37.1 
 
 		 244 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  37.29 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  38.89 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  37.93 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  37.93 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  41.27 
 
 		 307 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  39.66 
 
 		 313 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>