50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4238 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  39.88 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  38.78 
 
 		 178 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  39.88 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  40.69 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  56.25 
 
 		 170 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  42.11 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  50 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  44.44 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  49.38 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  51.25 
 
 		 174 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  57.83 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  45.98 
 
 		 604 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  45.98 
 
 		 584 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  45.98 
 
 		 448 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  45.98 
 
 		 544 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  45.98 
 
 		 544 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  45.98 
 
 		 521 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  45.98 
 
 		 355 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  44.57 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  47.37 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  48.68 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  43.53 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  50 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  44.87 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  43.59 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  42.86 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  40 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  43.59 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  40.26 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  39.74 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  40 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  39.13 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  34.94 
 
 		 90 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  36.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  34.57 
 
 		 119 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  34.57 
 
 		 119 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  38.89 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  32.88 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  32.88 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  46.81 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  34.25 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  38.89 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  32.88 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  33.33 
 
 		 117 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  32.05 
 
 		 125 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  32.88 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  32.91 
 
 		 175 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  32.89 
 
 		 118 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>