70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3008 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  100 
 
 		 106 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  41.18 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  41.79 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  43.28 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.28 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  37.84 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  39.13 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  46.27 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  41.94 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  39.71 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  42.86 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  42.86 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  35.82 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  39.71 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  38.36 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  42.86 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  35.82 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  35.82 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  38.36 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  43.08 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  42.19 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  34.21 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  38.96 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  46.15 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  46.15 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  37.88 
 
 		 216 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.81 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  39.68 
 
 		 223 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  35.38 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  33.82 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  30.3 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  34.57 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  34.57 
 
 		 303 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  40.68 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  38.33 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  31.51 
 
 		 228 aa  47.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  38.81 
 
 		 216 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  39.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  39.71 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  32.91 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  32.61 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  31.82 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  35.44 
 
 		 308 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.06 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  36.67 
 
 		 214 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  32 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  36.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  40.82 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  40.82 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  34.88 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  36.67 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  36.67 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  34.48 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  35.38 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  29.85 
 
 		 220 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  32.35 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  33.9 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3347  transport-associated  37.1 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0766802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  28.4 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  25.76 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  33.82 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  32.31 
 
 		 244 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  32.86 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  32.84 
 
 		 233 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  36.67 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  36.67 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  27.42 
 
 		 216 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  32.14 
 
 		 226 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>