28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4477 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4477  putative phophoslipid binding protein  100 
 
 		 330 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.780877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  39.39 
 
 		 174 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  34.85 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  36.36 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  26.32 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  23.9 
 
 		 216 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  34.85 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  24.55 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  34.85 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  26.01 
 
 		 543 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  36.36 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  23.38 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2153  putative phophoslipid binding protein  35.9 
 
 		 127 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  25.35 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  32.41 
 
 		 140 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  44 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  34.83 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  26.83 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  42.25 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  23.96 
 
 		 228 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  36.47 
 
 		 112 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  34.09 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  26.39 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  32.26 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  42.19 
 
 		 110 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  26.85 
 
 		 215 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  31.43 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  33.33 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>