123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0425 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  86.92 
 
 		 214 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  81.31 
 
 		 214 aa  349  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  47.91 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  48.37 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  49.53 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  46.3 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  51.89 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  51.89 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  45.58 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  45.37 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  41.67 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  42.06 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  41.67 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  42.59 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  44.13 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  42.33 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  46.26 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  39.35 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  41.59 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  44.13 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  44.13 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  40.19 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  38.97 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  40.95 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  43.19 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  37.26 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  38.57 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  38.97 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  38.68 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  40.85 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  37.56 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  39.72 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  40.19 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  38.99 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  40.09 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  37.74 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  37.56 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  36.02 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  36.02 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  36.19 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  44.8 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  38.5 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  37.26 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  42.58 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  35.85 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  36.15 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  78.21 
 
 		 108 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  76.92 
 
 		 108 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  38.97 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  37.62 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  38.97 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  37.56 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  33.81 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  34.74 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  34.27 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  39.15 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  39.15 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  39.29 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  39.29 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  33.87 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  40.94 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  33.01 
 
 		 543 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  30.05 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  26.26 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  26.53 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  32.54 
 
 		 628 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  28.44 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  26.67 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  27.52 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  33.33 
 
 		 86 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26.49 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  27.52 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  27.93 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  26.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  26.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  26.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  28 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  24.88 
 
 		 279 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  21.86 
 
 		 295 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  26.51 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  27.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  27.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  27.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  27.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  27.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  25.58 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  30.97 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  31.86 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  21.05 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  31.67 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>