116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0204 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  43.78 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  43.06 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.06 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  42.4 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  42.59 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  43.98 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  43.33 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  42.72 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  40.55 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  41.94 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  40.55 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  42.79 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  41.2 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  43.19 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  43.06 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  43.87 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  44.65 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  44.65 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  45.83 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  45.28 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  43.72 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  44.44 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  41.47 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  47.22 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  42.06 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  42.72 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  43.78 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  40.09 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  43.98 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  39.07 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  40.98 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  39.35 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  40.74 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.99 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.35 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  39.35 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  40.09 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  37.04 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  37.04 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  39.52 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  35.51 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  41.2 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  41.98 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  42.45 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  40 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  36.87 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  38.57 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  36.41 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  37.2 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  39.25 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  42.95 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  42.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  42.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  42.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  42.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  42.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  38.6 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  38.6 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  38.6 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  38.6 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  38.14 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  38.14 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  38.6 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  35.48 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  35.94 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  43.59 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  42.05 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  36.11 
 
 		 141 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  31.07 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  25.39 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  41.18 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  32.33 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  26.64 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.73 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.73 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.73 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  39.13 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 628 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  28.28 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.51 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  29.53 
 
 		 295 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.41 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.75 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  38.96 
 
 		 108 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  43.28 
 
 		 108 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  24.88 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.25 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  25 
 
 		 543 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  25.85 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0932  transport-associated  27.59 
 
 		 131 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  31.4 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 303 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  26.52 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  39.13 
 
 		 315 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  31.75 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  29.13 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  29.13 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  29.13 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  29.13 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>