151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4061 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  100 
 
 		 213 aa  400  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  50.94 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  52.13 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  43.13 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  43.13 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  41.51 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  41.31 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  41.31 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  39.25 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  40.85 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  45.54 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.79 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  40.28 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  40.85 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  40.09 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  40.09 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  42.25 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  36.74 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  42.65 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  39.25 
 
 		 215 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  38.97 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  42.06 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  41.86 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.34 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  41.86 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  42.18 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  40.28 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  42.38 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  42.25 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  42.25 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  39.35 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  43.72 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  39.17 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  38.86 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  38.36 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  35.48 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  41.31 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  41.62 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  39.44 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  43.33 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  36.32 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  43.33 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  39.47 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  37.98 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  39.45 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  35.21 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  42.45 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  37.91 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  40.19 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.12 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  34.91 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  38.68 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  40.57 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  40.57 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  40.57 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  40.57 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  40.57 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  40.57 
 
 		 237 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  39.6 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  37.5 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  35.85 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  39.15 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  39.15 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  40.54 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  38.51 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  30.09 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  35.38 
 
 		 543 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  28.14 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  26.91 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  33.17 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.29 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.29 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.29 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  34.43 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  25.56 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  46.67 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  45.33 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.15 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.43 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  30.77 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  29.63 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  28.99 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  29.33 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  37.14 
 
 		 628 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  24.47 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  29.71 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  30.07 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  30.07 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  30.07 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  30.07 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  30.07 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>