228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2553 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  83.81 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  51.27 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  38.7 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  39.66 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  39.83 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  30.15 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  29.04 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  30.51 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  28.84 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  29.69 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  33.53 
 
 		 199 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  52.24 
 
 		 114 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  30.71 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  52.24 
 
 		 114 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  47.76 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  31.01 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  26.41 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  44.78 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  30.89 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  44.93 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  25.46 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  36.08 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  27.57 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  30.38 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  29.28 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  37.19 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  25.21 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  33.08 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  33.6 
 
 		 181 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  32.82 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  34.95 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  34.62 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  29.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  25.68 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  25.53 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  29.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  29.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  29.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  29.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  49.23 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  29.33 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  49.23 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.29 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  49.23 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  32.52 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  32.52 
 
 		 184 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  32.52 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  29.15 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  28.67 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  23.4 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  26.34 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  34.15 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  31.15 
 
 		 201 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  23.53 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  32.17 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  44.78 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  25.68 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  26.18 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  28.29 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  32.52 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  32.52 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  24.32 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  30.23 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  35.25 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  26.75 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  29.33 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  44.78 
 
 		 116 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  30.43 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  48.39 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  28.21 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  44.78 
 
 		 116 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  38.71 
 
 		 116 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  27.07 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  41.79 
 
 		 116 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  29.75 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  38.71 
 
 		 116 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  23.98 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  26.71 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  30.97 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  23.39 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.14 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  27.61 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  38.81 
 
 		 115 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  29.38 
 
 		 161 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  27.85 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  27.61 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  28.03 
 
 		 205 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  47.69 
 
 		 202 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  23.98 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  27.85 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  28.77 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  26.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  27.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  22.88 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  26.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  24.68 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>