143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4484 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  88.89 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  82.91 
 
 		 116 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  76.47 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  70.94 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  75.21 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  75.21 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  55.34 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  55.34 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  51.72 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  47.01 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  49.06 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  54.17 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  44.55 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  43.64 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  48.48 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  41.03 
 
 		 276 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  47.62 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  48.19 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  50.7 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  41.67 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  44.87 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  51.32 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  51.32 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  41.43 
 
 		 275 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  56.25 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  50.72 
 
 		 171 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  50.72 
 
 		 171 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  36.92 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  36.92 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  39.64 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  39.64 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  39.64 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  37.5 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  45.9 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  35.78 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  33.96 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  50.79 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  33.61 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  45.31 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  45.31 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  45.31 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  50.79 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  39.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  39.71 
 
 		 273 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  39.71 
 
 		 273 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  42.62 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  42.62 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  40.54 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  40.54 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  40.54 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  40 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  42.42 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  44.93 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  42.86 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  39.71 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  51.61 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  36.56 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  40.91 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  40.98 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  41.27 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  46.27 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  46.27 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  46.27 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  46.27 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  45.9 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  36.51 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  46.27 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  48.39 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  37.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  37.1 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  44.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  37.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  37.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  44.78 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  54.29 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>