213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04303 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  100 
 
 		 120 aa  234  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  56.03 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  47.47 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  47.47 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  53.33 
 
 		 116 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  44.55 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  53.33 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  47.31 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  49.09 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  49.53 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  47.31 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  44.14 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  47.31 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  46.6 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  57.35 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  43.24 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  60.94 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  40.2 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  50.75 
 
 		 275 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  54.17 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  50 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  49.3 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  47.89 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  40.54 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  40.54 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  40.54 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  40.54 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  40.54 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  44.78 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  39.02 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  39.64 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  36 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  39.02 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  45.78 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  45.78 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  46.99 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  48.44 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  53.23 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  43.24 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  48.39 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  48.39 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  45.83 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  48.39 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  50 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  46.03 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  46.03 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  42.31 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  48.33 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  36.19 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  51.61 
 
 		 218 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  41.46 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  51.67 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  51.67 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  51.67 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  42.86 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  45.31 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  46.67 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  42.86 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  44.62 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  47.54 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  42.86 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  37.04 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  51.67 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  46.67 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  41.79 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  48.33 
 
 		 190 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  41.67 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  51.67 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  45 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  45 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  43.94 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  50.82 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  43.75 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  40.91 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  46.77 
 
 		 196 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>