115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2052 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  100 
 
 		 139 aa  271  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  40.74 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  51.28 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  51.35 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  47.44 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  47.44 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  47.44 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  46.15 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  46.15 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  35.07 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  33.33 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  46.15 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  31.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  40.51 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  40.51 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  50 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  43.59 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  33.08 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  47.22 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  44.59 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  37.69 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  28.37 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  37.01 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  35.88 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  43.06 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  46.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  33.33 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  37.01 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  37.01 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  37.01 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  37.01 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  37.01 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  33.33 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  39.47 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  41.79 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  27.27 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  45.31 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  44.93 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  51.56 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  38.57 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  44.78 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  46.05 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  46.05 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  44.62 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  50 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  34.86 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  40 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  37.84 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  34.74 
 
 		 202 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  43.08 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  44.87 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  37.18 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  40.28 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  32.22 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  29.46 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  41.89 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  53.12 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  53.12 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  50.77 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  38.95 
 
 		 218 aa  48.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  31.46 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  46.05 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  39.24 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  43.48 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  43.48 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  32 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  39.47 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  42.42 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  40 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  42.42 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  45 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  39.47 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  39.47 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  32.1 
 
 		 307 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  51.61 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  32.18 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  40.62 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  43.33 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  35.21 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  42.42 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  35.21 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3347  transport-associated  37.31 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0766802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  36.76 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  39.71 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  39.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  39.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  36.36 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1649  transport-associated protein  35.94 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  35.82 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>