107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2909 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  100 
 
 		 104 aa  204  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  72.41 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  60.19 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  62.89 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  61.86 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  59.22 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  57 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  60.19 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  60.19 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  65.06 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  56.7 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  47.47 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  41.18 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  45.98 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  39.42 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  44.58 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  44.34 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  35.71 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  34.69 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  46.84 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  46.84 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  46.84 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  37.62 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  45.83 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  37.36 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  37.5 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  38.55 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  37.62 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  43.21 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  42.31 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  43.24 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  40.26 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  43.84 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  43.84 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  43.84 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  42.5 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  36.59 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  36.59 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  40.79 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  40.79 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  40.79 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  40.79 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  40.79 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  39.47 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  39.44 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  41.1 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  38.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  40 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  40.85 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  38.16 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  39.74 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  40 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  40.28 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  37.04 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  44.93 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  41.11 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  32.94 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  47.83 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  38.24 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  36.71 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  40 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  37.31 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  36.76 
 
 		 276 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  40 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  37.68 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  36.11 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  36.11 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  35.29 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  34.18 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  36.11 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  36.11 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  40.3 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  35.21 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  34.18 
 
 		 244 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  40.3 
 
 		 215 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  40.3 
 
 		 215 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  38.57 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  33.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  34.18 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  34.25 
 
 		 279 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  33.72 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  34.18 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  37.18 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  28.97 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1796  transport-associated  38.57 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.24 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  36.99 
 
 		 166 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  38.24 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  35.21 
 
 		 191 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  35 
 
 		 184 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  42.62 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  37.31 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>