65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1796 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1796  transport-associated  100 
 
 
108 aa  213  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  43 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  38.38 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  36.67 
 
 
204 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  39.77 
 
 
205 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.89 
 
 
204 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.89 
 
 
204 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.89 
 
 
204 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  41.56 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  38.64 
 
 
201 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  38.64 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  38.71 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  36.67 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  36.67 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  36.67 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  36.67 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  36.67 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  44.29 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  40.74 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  37.5 
 
 
201 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  42.71 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  37.97 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  38.27 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  32.08 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  34.41 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  38.14 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  36.84 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  35.78 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  43.24 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  35.44 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  35.44 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  40 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  34.18 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  39.24 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  36.76 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  34.07 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  34.07 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  29.03 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  34.07 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  34.21 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.11 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  40 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  41.18 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  35.14 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  40.85 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  39.39 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  38.57 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  41.27 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  40.45 
 
 
245 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  33.02 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  38.37 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  37.14 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  46.88 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  33.98 
 
 
103 aa  40.8  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  33.98 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  36.99 
 
 
144 aa  40.8  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  34.21 
 
 
202 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  45.16 
 
 
135 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>