169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6387 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  81.34 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  79.41 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  79.41 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  70.37 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  39.84 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  36.69 
 
 		 174 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  39.42 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  39.42 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  39.42 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  41.35 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  43.43 
 
 		 246 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  41.35 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  40.38 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  37.5 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  37.33 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  37.78 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  33.33 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  32.73 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  35.9 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  36.46 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  32.14 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  35 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  38.24 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  36.94 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  36.67 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  36.25 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  34.48 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  36.45 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  37.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  41.67 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  39.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  28.8 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  34.23 
 
 		 202 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  43.84 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  35.23 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  32.41 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  33.91 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  33.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  33.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  33.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  33.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  33.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  33.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  30.11 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  30.85 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  35.14 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  36.99 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  47.27 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  34.67 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  44.26 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  33.77 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  37.5 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0997  lipoprotein  61.11 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1285  transport-associated domain-containing protein  61.11 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.97 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  37.31 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  36.49 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.97 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  32.88 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  39.44 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  42.65 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  34.25 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.97 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  42.62 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  40 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  44.26 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  36.05 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  35.62 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  36.62 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  42.62 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  40.32 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  40.32 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  40.32 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  30.38 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  42.62 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  34.72 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  34.72 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  38.89 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  38.89 
 
 		 294 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  38.89 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  38.89 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  30.53 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>