72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2078 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  100 
 
 		 113 aa  224  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.26 
 
 		 199 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  36.19 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  30.39 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  35.51 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  35.42 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  30.39 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  31.91 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  33.64 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  38.57 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  31.03 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  37.68 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  36.76 
 
 		 202 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  30.77 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  36.23 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  34.78 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  36.76 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  24.32 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  37.68 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  34.78 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  30.43 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  26.21 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  36.76 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  38.24 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  28.99 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  28.99 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  25.22 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  36.23 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  38.24 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  31.08 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  35.21 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  29.09 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.81 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  25.96 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  29.73 
 
 		 163 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  27.03 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  33.82 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.57 
 
 		 245 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  24.04 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  30.99 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  34.85 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  35.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  36.51 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  25.45 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  35.29 
 
 		 201 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  32.86 
 
 		 103 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>