95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3849 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  100 
 
 		 115 aa  225  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  76.52 
 
 		 115 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  38.26 
 
 		 192 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.74 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  40.91 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  33.04 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  30.39 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  36.59 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  40 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  41.67 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  34.19 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  35.35 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  38.24 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  37.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  37.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  37.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  40.85 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.38 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.38 
 
 		 204 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.38 
 
 		 204 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  43.08 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.9 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  40.3 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  35.29 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  38.46 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  38.67 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  35.29 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  30.7 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  36.76 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  38.24 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  35.21 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  28.74 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  29.09 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  37.31 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  35.21 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  39.68 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  33.82 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  37.31 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  39.68 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  29.85 
 
 		 273 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  37.31 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  35.29 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  35.29 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  36.76 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  28.44 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  30.63 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  36.76 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  28.44 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  40.98 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  35.29 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  34.21 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  34.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  37.66 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  30.86 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  31.87 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  35.82 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  40.3 
 
 		 245 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  34.33 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  39.39 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  32.35 
 
 		 282 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  38.98 
 
 		 119 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  35.29 
 
 		 104 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  34.33 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  34.33 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  35.82 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  26.36 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  38.1 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  35.82 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  38.1 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  37.31 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  36.36 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  28.36 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  32.35 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  32.04 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  37.88 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  34.33 
 
 		 326 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  40.32 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  31.62 
 
 		 123 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  31.62 
 
 		 123 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  31.62 
 
 		 123 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>