75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1925 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  70.59 
 
 		 273 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  63.97 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  63.6 
 
 		 271 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  63.24 
 
 		 271 aa  352  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  62.5 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  59.19 
 
 		 275 aa  338  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  25.99 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  27.17 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.8 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  26.16 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  26.5 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  27.89 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  25.24 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  26.77 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  26.18 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  27.37 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.87 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  24.06 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  25.5 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  24.02 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  25.52 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  21.72 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  24.47 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  28.26 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  24.71 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  25.4 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  30.53 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  25.77 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  22.89 
 
 		 207 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  20.88 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  23.98 
 
 		 428 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  22.87 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  35.21 
 
 		 120 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  24.15 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  27.84 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  23.53 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  25.14 
 
 		 182 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  22.07 
 
 		 242 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  27.66 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  23.28 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  31.94 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  29.79 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.78 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  22.71 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  33.87 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  26.76 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  26.76 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  27.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.55 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  23.53 
 
 		 210 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.55 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  34.33 
 
 		 115 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  29.76 
 
 		 171 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  29.76 
 
 		 171 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.55 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>